| 第1話 『戦火、ふたたび』 | ||
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| 第2話 『あえて汚名を』 | ||
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| 第3話 『勝利へのVサイン』 | ||
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| ルート選択 | ||
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| リーンホース隊（月へ） | アーガマ隊(極東支部へ) | |
| 第4話 『13番目の星座』 | 第4話 『正義は我にあり』 | |
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| 第5話 『月のゆりかご』 | 第5話 『鎖を解き放て』 | |
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| 第6話 『情け無用のJ9』 | 第6話 『お呼びとあらば即参上』 | |
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| 第7話 『終わらない円舞曲』 | ||
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| 第8話 『ヌビアは笑い』 | ||
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| 第9話 『愚者の祭典』 | ||
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| 第10話 『遙かなる時の彼方』 | ||
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| 第11話 『なんで掟をやぶるのさ』 | ||
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| 第12話 『謎また謎のイノセント』 | ||
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| 第13話 『罪なき者の聖域』 | ||
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| ルート選択 | ||
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| フォートセバーンに直行する | フォートセバーンに直行しない | |
| 第14話 『月は出ているか』 | 第14話 『招かれざる客』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第15話 『あなたに、力を…』 | 第15話 『ディアナ降臨』 | |
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| 第16話 『ガンダム、売るよ』 | 第16話 『ローラ＝ローラ』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第17話 『月の民』 | 第17話 『白い悪魔』 | |
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| ルート選択 | ||
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| フォートセバーンへ行く | ビシニティに残る | |
| 第18話 『僕がニュータイプだ』 | 第18話 『機械の獣たち』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第19話 『共鳴する力』 | 第19話 『百年の恋』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第20話 『過去からの侵略』 | 第20話 『黒歴史の遺産』 | |
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| 第21話 『地上をこの手に』 | ||
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| 第22話 『謎のランドシップ』 | ||
| ┃ | ||
| 第23話 『Loreieiの海』 | ||
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| 第24話 『大地の守護神』 | ||
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| 第25話 『もう逢えない気がして』 | ||
| ┃ | ||
| 難易度のよってルート変更 | ||
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| 「易」＆「普」 | 「難」 | |
| 第26話 『破れかぶれのラグ』 | 第26話 『果てしない大空に誓う』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第27話 『捨て身と捨て身の大戦闘』 | 第27話 『ホーラの意地』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第28話 『暗黒大将軍の挑戦』 | 第28話 『イノセントの黒歴史』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第29話 『女の心をあやつれば』 | 第29話 『女いろいろ万華鏡』 | |
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| 第30話 『イノセントを統べるもの』 | ||
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| 第31話 『天地を灼く剣』 | ||
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| ルート選択 | ||
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| 月へ向かう | Ｘポイントへ向かう | |
| 第32話 『飛べ、宇宙へ』 | 第32話 『姿なき恐竜空爆隊』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第33話 『ターンＸ起動』 | 第33話 『エルチ目覚めよ』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第34話 『時を超えた対決』 | 第34話 『この星は僕らのものだ』 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第35話 『私はD.O.M.E.… 黒歴史を封印する者』 |
第35話 戦闘神降臨 | |
| ┃ | ┃ | |
| 第36話 『奪われた慎・ゲッターロボ』 | ||
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| 第37話 『僕らが求めた戦争だ』 | ||
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| 第38話 『月光蝶』 | ||
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| 第39話 『決戦！ Xポイント』 | ||
| ┃ | ||
| 第40話 『ABAYO』 | ||
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| 難易度のよってルート変更 | ||
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| 「易」＆「普」 | 「難」 | |
| 第41話 『黒歴史の終焉』 | ||
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| 第42話 『竜が滅ぶ日』 | ||
| ┃ | ||
| 第43話 『人類死すべし』 | ||
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| 第44話 『未来は誰のために』 | ||
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| 最終話 『ラグナロク』 |